用新冠病毒遗传指纹快速绘制其传播图谱

医牛资讯原创 2020-02-21 新型冠状病毒|传播|图谱 (561)

2月13日从西雅图召开的美国科学促进协会年会传来消息,一项前所未有的数据共享和危险基因调查研究正在绘制COVID-19新型冠状病毒的全球传播图谱。

巴西

位于Fred Hutch的美国西雅图癌症研究中心的计算生物学家特雷弗·贝德福德(Trevor Bedford) 和他的同事通过对这种被称为COVID-19新型冠状病毒的微小遗传变异进行编目发现,这种病毒正在中国武汉蔓延,并在其他地方开启了规模小得多的传播链。

该图谱于2月13日在美国科学促进会(American Association for the Advancement in Science)的年会上公布。科学家们正在www.nextstrain.org网上进行广泛合作,不断对数据进行更新。贝德福德说,绘制这些遗传谱系图将有助于科学家描绘出这种病毒可能具有的能力,以及干预措施是否有助于减缓其传播。

日本

自从这种病毒首次出现以来,世界各地的科学家一直在热烈地交换数据,这些数据包括感染人类的病毒的基因细节。截止2月12日,世界各地的研究小组已经共享了100多个病毒样本的基因组成。通过比较这些基因组,贝德福德和他的同事们拼组出了一个病毒家谱。他表示,“我们可以在地图上画出来,因为我们知道这个基因组通过这些突变与这个基因组相连,这样我们就可以了解这些传输链的路径。”

贝德福德表示,研究人员发现COVID-19病毒在全球传播的过程中发生了一些变异,但没有发现任何迹象表明该病毒的毒性在增强。对于一个正在传播的病毒,突变是意料之中的;病毒通常具有“非常容易出错的复制形式”,例如,季节性流感突变每10天发生一次,但目前研究人员并不担心COVID-19的突变会突然变得特别严重。”

埃及

 基因图谱还表明,这种新的冠状病毒与2013年在中国发现的一种蝙蝠冠状病毒密切相关。但贝德福表示,这两种菌株在20到70年前就已经分化了。从那以后,人类真的不知道这种冠状病毒去了哪里。